Vedoucí oddělení: doc. RNDr. Ivan RYCHLÍK, Ph.D.
Tel.: +420 533 331 201
E-mail: rychlik@vri.cz
Oddělení je zaměřeno zejména na diagnostiku, epidemiologii a prevenci bakteriálních infekcí zvířat, včetně studia střevní mikroflóry a jejich vlivu na odolnost zvířat a produkční parametry. Výzkum je věnován také mikrobiologii potravin. Součást oddělení je Sbírka zoopatogenních mikroorganismů.
Výzkumné skupiny
Vedoucí výzkumné skupiny: Mgr. Petra VAŠÍČKOVÁ, Ph.D.
Tel.: +420 777 786 756
E-mail: vasickova@vri.cz
Odborné zaměření:
- zpracování terénních vzorků pro průkaz mykobakterií (mikroskopie, kultivace, sekvenování, PCR, real-time PCR)
- vyšetření biologických vzorků na přítomnost Mycobacterium sp. pomocí kultivačně nezávislých metod
- sérologická diagnostika vybraných druhů mykobakterií (MAPIA, ELISA testy)
- provádění epidemiologických studií u vybraných zástupců rodu Mycobacterium (Mycobacterium avium subsp. avium, M. a. subsp. paratuberculosis, M. a. subsp. hominissuis)
Vedoucí výzkumné skupiny: doc. RNDr. Ivan RYCHLÍK, Ph.D.
Tel.: +420 533 331 201
E-mail: rychlik@vri.cz
Výzkumná skupina řeší problematiku diagnostiky, patogeneze, imunoprofylaxe a terapie salmonelových infekcí hospodářských zvířat s hlavním důrazem na drůbež. V menším rozsahu se zabýváme i mechanismy rezistencí k antibiotikům u salmonel. Mimo salmonelové infekce se tato skupina zabývá studiem střevní mikroflóry drůbeže a jejímu vztahu k zdravotnímu stavu, věku nebo antibioterapii. Mezi klíčové metodické přístupy patří NextGen sekvenování a proteinová hmotnostní spektrometrie.
Vedoucí výzkumné skupiny: MVDr. Markéta REICHELOVÁ.
Tel.: +420 533 332 131
E-mail: reichelova@vri.cz
Činnost Sbírky zoopatogenních mikroorganismů (Collection of Animal Pathogenic Microorganisms, CAPM) je zaměřena na získávání, uchovávání a poskytovaní kultur živočišných virů a zoopatogenních baktérií významných z hlediska veterinární medicíny.
Sbírka je zařazena do Národního programu konzervace a využívání genetických zdrojů mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu.
CAPM uchovává téměř 600 kmenů virů a 1400 kmenů baktérií. Ve sbírce jsou také uloženy buněčné kultury a mikroorganismy, které jsou předmětem patentového řízení na národní úrovni. Informace o kmenech dostupných pro odbornou veřejnost jsou poskytovány formou tištěných katalogů a databáze v elektronické podobě je přístupná na adrese https://capm.vri.cz/ a webových stránkách VÚRV Praha http://www.vurv.cz/collections/vurv.exe/search?lang=cz.
Vedoucí výzkumné skupiny: doc. MVDr. Renáta KARPÍŠKOVÁ, Ph.D.
Tel.: +420 777 786 322
E-mail: karpiskova@vri.cz
Laboratoř je akreditována dle ČSN EN ISO/IEC 17025. Provádí diagnostiku významných zoonotických původců (salmonely, listerie, kampylobaktery, MRSA aj.) v biologickém materiálu, potravinách a prostředí. Dále se zabývá typizací bakteriálních kmenů fenotypovými i genotypovými metodami a stanovením rezistence baktérií k antimikrobiálním látkám. Laboratoř úzce spolupracuje s kontrolními orgány Ministerstva zemědělství (SVS a SZPI) a dále s Hygienickou službou Ministerstva zdravotnictví (hygiena výživy, epidemiologové).