Oddělení mikrobiologie a antimikrobiální rezistence – Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.

Virologie potravin a prostředí

Salmonelózy hospodářských zvířat

Probiotika a zdraví zvířat

Sbírka zoopatogenních mikroorganismů

Zoonózy a antibiotická rezistence

Vedoucí výzkumné skupiny: Mgr. Petra VAŠÍČKOVÁ, Ph.D.
Tel.: +420 777 786 756
E-mail: vasickova@vri.cz

Výzkumná skupina se zabývá aspekty bezpečnosti potravin a prostředí z hlediska možnosti jejich kontaminace virovými agens. Mezi hlavní témata patří vývoj molekulárně biologických metod s tím souvisejících a studium molekulární epidemiologie. Laboratoř je akreditována dle ČSN EN ISO/IEC 17025:2018. Provádí detekci původců významných virových alimentárních infekcí (virus hepatitidy A, virus hepatitidy E, humánní noroviry, adenoviry aj.) v potravinách, prostředí a biologickém materiálu. Úzce spolupracuje s kontrolními orgány Ministerstva zemědělství (SZPI), správními úřady a zařízeními Ministerstva zdravotnictví (KHS, SZÚ, ZÚ).

Vedoucí výzkumné skupiny: doc. RNDr. Ivan RYCHLÍK, Ph.D.
Tel.: +420 533 331 201
E-mail: rychlik@vri.cz

Výzkumná skupina řeší problematiku diagnostiky, patogeneze, imunoprofylaxe a terapie salmonelových infekcí hospodářských zvířat s hlavním důrazem na drůbež. V menším rozsahu se zabýváme i mechanismy rezistencí k antibiotikům u salmonel. Mimo salmonelové infekce se tato skupina zabývá studiem střevní mikroflóry drůbeže a jejímu vztahu k zdravotnímu stavu, věku nebo antibioterapii. Mezi klíčové metodické přístupy patří NextGen sekvenování a proteinová hmotnostní spektrometrie.

Vedoucí výzkumné skupiny: Mgr. Monika MORÁVKOVÁ, Ph.D.
Tel.: +420 777 786 732
E-mail: moravkova@vri.cz

Hlavní pozornost skupiny je věnována problematice udržitelnosti zdraví zvířat z pohledu hledání alternativních přístupů k používání antibiotik, se zaměřením na probiotické bakterie a studium mikrobiomů trávicích traktů zvířat se zaměřením na prasata. Výzkum je soustředěn jak na výběr vhodných probiotických mikroorganismů, tak i na vztah jednotlivých složek krmiva na podporu probiotických kmenů. V současné době se skupina zabývá charakterizací a výběrem vhodných probiotických kmenů bakterií mléčného kvašení z trávicího traktu divokých a domácích prasat se zapojením rozvíjejících se technik sekvenování nové generace (NGS). Kromě této problematiky skupina řeší i využití molekulárních metod pro detekci vybraných druhů bakterií, kvasinek, řasy Prototheca spp. a parazitárních agens ovlivňujících zdraví zvířat lidí a kvalitu potravin.

Vedoucí výzkumné skupiny: MVDr. Markéta REICHELOVÁ.
Tel.: +420 533 332 131
E-mail: reichelova@vri.cz

Činnost Sbírky zoopatogenních mikroorganismů (Collection of Animal Pathogenic Microorganisms, CAPM) je zaměřena na získávání, uchovávání a poskytovaní kultur živočišných virů a zoopatogenních baktérií významných z hlediska veterinární medicíny.
Sbírka je zařazena do Národního programu konzervace a využívání genetických zdrojů mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu.
CAPM uchovává téměř 600 kmenů virů a 1400 kmenů baktérií. Ve sbírce jsou také uloženy buněčné kultury a mikroorganismy, které jsou předmětem patentového řízení na národní úrovni. Informace o kmenech dostupných pro odbornou veřejnost jsou poskytovány formou tištěných katalogů a databáze v elektronické podobě je přístupná na adrese https://capm.vri.cz/ a webových stránkách VÚRV Praha http://www.vurv.cz/collections/vurv.exe/search?lang=cz.

Vedoucí výzkumné skupiny: doc. MVDr. Renáta KARPÍŠKOVÁ, Ph.D.
Tel.: +420 777 786 322
E-mail: karpiskova@vri.cz

Laboratoř je akreditována dle ČSN EN ISO/IEC 17025. Provádí diagnostiku významných zoonotických původců (salmonely, listerie, kampylobaktery, MRSA aj.) v biologickém materiálu, potravinách a prostředí. Dále se zabývá typizací bakteriálních kmenů fenotypovými i genotypovými metodami a stanovením rezistence baktérií k antimikrobiálním látkám. Laboratoř úzce spolupracuje s kontrolními orgány Ministerstva zemědělství (SVS a SZPI) a dále s Hygienickou službou Ministerstva zdravotnictví (hygiena výživy, epidemiologové).

Výzkumné skupiny